Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YDB2

4930469K13Rik, RIKEN cDNA 4930469K13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930469K13RikA0A286YDB2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4930469K13RikA0A286YDB2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
4930469K13RikA0A286YDB2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930469K13RikA0A286YDB2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930469K13RikA0A286YDB2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms