Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Trbv13-2A0A140T8N6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv13-2A0A140T8N6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trbv13-2A0A140T8N6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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