Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Trbv2A0A0B4J1G8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trbv2A0A0B4J1G8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Trbv2A0A0B4J1G8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Trbv2A0A0B4J1G8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Trbv2A0A0B4J1G8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv2A0A0B4J1G8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Trbv2A0A0B4J1G8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Trbv2A0A0B4J1G8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Trbv2A0A0B4J1G8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv2A0A0B4J1G8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Trbv2A0A0B4J1G8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trbv2A0A0B4J1G8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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