Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Gm28171A0A087WQ19 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28171A0A087WQ19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Gm28171A0A087WQ19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm28171A0A087WQ19 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm28171A0A087WQ19 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Gm28171A0A087WQ19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Gm28171A0A087WQ19 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Gm28171A0A087WQ19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Gm28171A0A087WQ19 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm28171A0A087WQ19 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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Gm28171A0A087WQ19 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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