Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv4A0A075B5I2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trbv4A0A075B5I2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trbv4A0A075B5I2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trbv4A0A075B5I2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trbv4A0A075B5I2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trbv4A0A075B5I2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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