Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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