Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rfx7F8VPJ6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rfx7F8VPJ6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms