Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hoxb3P09026 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxb3P09026 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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