Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kif3aP28741 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kif3aP28741 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms