Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Speer4aF8VPX6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Speer4aF8VPX6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms