Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933424G06RikA0A140LIP3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms