Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933424G06RikA0A140LIP3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933424G06RikA0A140LIP3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms