Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gm3550W4VSN7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3550W4VSN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3550W4VSN7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms