Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rpl9-ps1S4R1R7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpl9-ps1S4R1R7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rpl9-ps1S4R1R7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rpl9-ps1S4R1R7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 230.3 ms