Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc166S4R181 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc166S4R181 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc166S4R181 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc166S4R181 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.4 ms