Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn7Q9Z261 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cldn7Q9Z261 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cldn7Q9Z261 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn7Q9Z261 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms