Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clic1Q9Z1Q5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clic1Q9Z1Q5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clic1Q9Z1Q5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Clic1Q9Z1Q5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms