Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nme3Q9WV85 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nme3Q9WV85 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nme3Q9WV85 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nme3Q9WV85 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.5 ms