Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apobec2Q9WV35 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apobec2Q9WV35 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Apobec2Q9WV35 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apobec2Q9WV35 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.2 ms