Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sh3bgrQ9WUZ7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sh3bgrQ9WUZ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3bgrQ9WUZ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms