Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkraQ9WTX2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkraQ9WTX2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkraQ9WTX2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkraQ9WTX2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms