Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdh13Q9WTR5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdh13Q9WTR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdh13Q9WTR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms