Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Psma4Q9R1P0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psma4Q9R1P0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psma4Q9R1P0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psma4Q9R1P0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms