Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmed2Q9R0Q3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmed2Q9R0Q3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms