Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Plod2Q9R0B9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Plod2Q9R0B9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Plod2Q9R0B9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms