Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clcn2Q9R0A1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clcn2Q9R0A1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clcn2Q9R0A1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Clcn2Q9R0A1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn2Q9R0A1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn2Q9R0A1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcn2Q9R0A1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms