Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BcamQ9R069 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BcamQ9R069 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BcamQ9R069 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BcamQ9R069 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BcamQ9R069 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms