Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh2d3cQ9QZS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh2d3cQ9QZS8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh2d3cQ9QZS8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms