Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Col4a4Q9QZR9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Col4a4Q9QZR9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a4Q9QZR9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a4Q9QZR9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a4Q9QZR9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms