Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpc3Q9QZC1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc3Q9QZC1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trpc3Q9QZC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trpc3Q9QZC1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms