Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rdh11Q9QYF1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rdh11Q9QYF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rdh11Q9QYF1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rdh11Q9QYF1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms