Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tomm40Q9QYA2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tomm40Q9QYA2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tomm40Q9QYA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.8 ms