Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Irx4Q9QY61 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Irx4Q9QY61 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Irx4Q9QY61 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Irx4Q9QY61 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Irx4Q9QY61 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms