Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY6

Ehd3, EH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ehd3Q9QXY6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ehd3Q9QXY6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ehd3Q9QXY6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ehd3Q9QXY6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ehd3Q9QXY6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms