Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cbx8Q9QXV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cbx8Q9QXV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cbx8Q9QXV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cbx8Q9QXV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cbx8Q9QXV1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms