Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT0

Cnpy2, Protein canopy homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy2Q9QXT0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cnpy2Q9QXT0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cnpy2Q9QXT0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cnpy2Q9QXT0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cnpy2Q9QXT0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms