Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pias4Q9JM05 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pias4Q9JM05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pias4Q9JM05 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pias4Q9JM05 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms