Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Bco1Q9JJS6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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Bco1Q9JJS6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Bco1Q9JJS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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Bco1Q9JJS6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Bco1Q9JJS6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Bco1Q9JJS6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Bco1Q9JJS6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Bco1Q9JJS6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bco1Q9JJS6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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