Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scube2Q9JJS0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scube2Q9JJS0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scube2Q9JJS0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scube2Q9JJS0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms