Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR5

Akip1, A-kinase-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akip1Q9JJR5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Akip1Q9JJR5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Akip1Q9JJR5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Akip1Q9JJR5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Akip1Q9JJR5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Akip1Q9JJR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms