Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJE7

Fads3, Fatty acid desaturase 3, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fads3Q9JJE7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fads3Q9JJE7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Fads3Q9JJE7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fads3Q9JJE7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Fads3Q9JJE7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fads3Q9JJE7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Fads3Q9JJE7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Fads3Q9JJE7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Fads3Q9JJE7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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Fads3Q9JJE7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fads3Q9JJE7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms