Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc12a4Q9JIS8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc12a4Q9JIS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc12a4Q9JIS8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc12a4Q9JIS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms