Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MkksQ9JI70 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MkksQ9JI70 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MkksQ9JI70 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MkksQ9JI70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms