Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn12Q9ET43 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn12Q9ET43 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cldn12Q9ET43 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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