Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sall1Q9ER74 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sall1Q9ER74 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sall1Q9ER74 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sall1Q9ER74 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sall1Q9ER74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall1Q9ER74 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sall1Q9ER74 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms