Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rims2Q9EQZ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rims2Q9EQZ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rims2Q9EQZ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Rims2Q9EQZ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Rims2Q9EQZ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.9 ms