Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tlr6Q9EPW9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tlr6Q9EPW9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tlr6Q9EPW9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tlr6Q9EPW9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms