Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl4Q9DCU6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl4Q9DCU6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl4Q9DCU6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mrpl4Q9DCU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl4Q9DCU6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mrpl4Q9DCU6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl4Q9DCU6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms