Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bap18Q9DCT6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bap18Q9DCT6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Bap18Q9DCT6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Bap18Q9DCT6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms