Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf6Q9DBU5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rnf6Q9DBU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rnf6Q9DBU5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rnf6Q9DBU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rnf6Q9DBU5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms